اثرات SNP-SNP بر روی RNA های سرطان زای درازغیر کدکننده HOTAIR و HOTTIP دراستعداد ابتلا به سرطان معده

خلاصه فارسی

نوع ژنتیکی در ژن‌های rna های غیر کدکننده و غیر کدکننده احتمالاً می‌تواند بر سطح بیان ژن آن‌ها اثر بگذارد و در نتیجه حساسیت ژنتیکی به سرطان معده را اصلاح کند. مواد و روش‌ها: در یک مطالعه مبتنی بر بیمارستان اردبیل - یک منطقه بسیار پرخطر در شمال غرب ایران, نمونه‌های خون با استفاده از دستگاه gc - ms مورد بررسی قرار گرفتند. پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (snp) پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (snp) و پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (snp) مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل داده‌ها با استفاده از نرم‌افزار spss16 انجام شد. هاپلوتیپ های g - c - t - a - t - t - a, خطر gc را تا حد زیادی افزایش داد. ارتباط معنی‌داری بین snp ها و ریسک gc مشاهده نشد. علایم بالینی و آسیب‌شناسی نیز با هیچیک از ویژگی‌های آسیب‌شناسی مرتبط نبود. واکنش snp - snp در رابطه با افزایش ریسک gc - snp مربوط به افزایش خطر gc بود. نکته جالب توجه این است که برهمکنش snp - snp با قارچ میکوریزا به شدت ریسک gc را افزایش می‌دهد. نتایج نشان داد که این پلی مورفیسم به طور معنی‌داری باعث افزایش معنی‌داری در میزان ابتلا به این بیماری می‌گردد. به طور خاص, برهمکنش‌های snp - snp بین snp ها و پلی مورفیسم های snp - snp اثرات بزرگ‌تری از اثرات snp بر ریسک gc دارند, در نتیجه اطلاعات ارزشمندی را برای آشکار ساختن سازوکارهای بیولوژیکی احتمالی برای توسعه دستگاه gc فراهم می‌کند.

عنوان انگليسی

SNP-SNP interactions of oncogenic long non-coding RNAs HOTAIR and HOTTIP on gastric cancer susceptibility

خلاصه انگلیسی

Genetic variants within oncogenic long non‑coding RNAs HOTAIR and HOTTIP may affect their gene expression levels, thereby modifying genetic susceptibility to gastric cancer (GC). In a hospital‑based study in Ardabil—a very high‑risk area in North‑West Iran, 600 blood samples from 300 GC patients and 300 healthy controls were recruited for genotyping. Seven HOTAIR (i.e., rs17720428, rs7958904, rs1899663, and rs4759314) and HOTTIP (i.e., rs3807598, rs17501292, and rs1859168) ‘tag’ single nucleotide polymorphisms (SNPs) were genotyped by the Infinium HTS platform. The rs17720428, rs7958904, and rs1899663 tagSNPs significantly increased GC risk under dominant models by 1.5‑, 1.57‑, and 1.5‑fold, respectively. The G‑C‑T‑A haplotype of HOTAIR tagSNPs increased the risk of GC by 1.31‑fold. No significant association was found between HOTTIP SNPs and the risk of GC. HOTAIR and HOTTIP variants were also not associated with any clinicopathologic characteristics. The SNP ‑SNP interaction of HOTAIR rs17720428/rs7958904 with HOTTIP rs1859168 was associated with an increased risk of GC (rs17720428 TG‑rs1859168 CC, OR = 1.76; rs7958904 GC‑rs1859168 CC, OR = 1.85; rs7958904 CC‑rs1859168 CC, OR = 1.86). Interestingly, the SNP‑SNP interaction of HOTAIR rs1899663 with HOTTIP rs1859168 strongly increased the risk of GC (rs1899663 GT‑rs1859168 CC, OR = 4.3; rs1899663 TT‑rs1859168 CC, OR = 9.37; rs1899663 TT‑rs1859168 CA, OR = 6.59). We showed that the HOTAIR rs17720428, rs7958904, and rs1899663 tagSNPs and their interactions with the HOTTIP rs1859168 polymorphism significantly increased the risk of GC. Specifically, novel SNP‑SNP interactions between HOTAIR and HOTTIP tagSNPs have a larger impact than individual SNP effects on GC risk, thereby providing us with valuable information to reveal potential biological mechanisms for developing GC.

Document Downloads