title

شناسایی و معرفی اهداف پروتئینی جدید بوسولیک اسیدها با تکنیک داکینگ مولکولی معکوس

سپهری, ساقی ، علیزاده هشی, ندا (1400) شناسایی و معرفی اهداف پروتئینی جدید بوسولیک اسیدها با تکنیک داکینگ مولکولی معکوس. دکتری حرفه ای (پایان نامه) دانشگاه علوم پزشکی اردبیل.

متن کامل






[img]
پیش نمایش
متنی - گزارش نهایی طرح تحقیقاتی/ پایان نامه
5MB
[img]
پیش نمایش
متنی - گزارش نهایی طرح تحقیقاتی/ پایان نامه
4MB
[img] متنی - گزارش نهایی طرح تحقیقاتی/ پایان نامه
محدود به فقط پرسنل سامانه

5MB
[img] متنی - گزارش نهایی طرح تحقیقاتی/ پایان نامه
محدود به فقط پرسنل سامانه

8MB
[img] سایر (data) - فایل ضمیمه
محدود به فقط پرسنل سامانه

43kB

آدرس اینترنتی رسمی : http://lib.arums.ac.ir

خلاصه فارسی

مقدمه و هدف بوسولیک اسید یکی از ترکیبات تری ترپنی پنج حلقه ای است که از گم رزین بوسولیا سراتا و بوسولیا کارتری بدست می آید. بوسولیک اسید از جمله ترکیباتی است که دارای اثر بر درمان و پیشگیری از آلزایمر و تقویت حافظه می باشد. در این مطالعه، اهداف جدیدی که بوسولیک اسید و مشتقات آن می توانند روی آن موثر باشند مورد بررسی قرار گرفتند. مواد و روش ها در پروژه حاضر تعداد 800 پروتئین مختلف که بوسولیک اسید و مشتقات آن روی آن ها اثر دارند از سایت PDB دریافت شد، سپس مراحل و فیلتر های مختلف روی آن ها اعمال گردید. در نهایت انرژی و برهمکنش های آن ها با استفاده از نرم افزار اتوداک مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها مشتقات استیل آلفا بوسولیک اسید و استیل لوپئولیک اسید به ترتیب با انرژی آزاد اتصال 10/40- و 11/13- کیلوکالری بر مول با تمایل بالا به جایگاه فعال پروتئین گیرنده استروژن متصل شدند و مشتقات 9و11-دهیدرو آلفا بوسولیک اسید، استیل 9و 11-دهیدروآلفا بوسولیک اسید، لوپئولیک اسید، استیل11-کتو بتا بوسولیک اسید و 11-کتو بتا بوسولیک اسید به ترتیب با انرژی آزاد اتصال 9/10-، 9/72-، 9/72-، 10/67-، 10/38- کیلوکالری برمول با تمایل بالا به جایگاه فعال آنزیم PI3K متصل شدند. این ترکیبات با جایگاه فعال پروتئین های ذکر شده برهمکنش های هیدروژنی و هیدروفوب مهمی برقرار کردند. بحث ونتیجه گیری در مطالعه اخیر که در جهت شناسایی و معرفی اهداف پروتئینی جدید بوسولیک اسید صورت گرفته بود، دو پروتئین گیرنده استروژن و آنزیم PI3K که بهترین اتصال را با بوسولیک اسید و مشتقات آن داشتند شناسایی و معرفی گردیدند. ارزیابی برهمکنش های این پروتئین ها با بوسولیک اسید و مشتقات آن نشان داد که احتمالاً اسید آمینه های Met804، Ile963، Asp964، Asp950، Met953، Ser806 و Asn951 نقش مهمی در اتصال این ترکیبات به جایگاه فعال آنزیم PI3K داشته باشند. همچنین به نظر می رسد احتمالا ً اسید آمینه هایMet343 ،Met421 ، Phe404، Met388، Leu387،Leu391 ،Arg394 ، Leu384،Glu353 ،Leu346،Leu349 ،Leu525 و His524 نقش مهمی در اتصال این ترکیبات به جایگاه فعال پروتئین گیرنده استروژن داشته باشند.

عنوان انگليسی

Identification of novel targets of Boswellic acids by inverse molecular docking

خلاصه انگلیسی

Introduction Boswellic acid is one of the five ring triterpene compounds that is obtained from the gemresin of Boswellia serrata and Boswellia carteri. Boswellic acid is one of the compounds that has an effect on the treatment and prevention of Alzheimer's and strengthens memory. In this study, new targets that boswellic acid and its derivatives can be affected were evaluated. Material and methods In the present project, 800 different proteins that are affected by boswellic acid and its derivatives were received from the PDB site. Then different steps and filters were applied on Proteins. Finally, their energy and interactions were investigated using Autodock software. Results Derivatives Acetyl-α-Boswellic Acid and Acetyl-lupeolic Acid were bounded to the active site of estrogen receptor protein with high binding free energy of -10.40 and -11.13 kcal/mol, and 9,11-dehydro-α-Boswellic Acid، Acetyl-9,11-dehydro-α-Boswellic Acid، Lupeolic acid، Acetyl-11-keto-β-Boswellic Acid، 11-keto-β- Boswellic Acid respectively with free binding energy of -9.10, -9.72, -9.72, -10.67 and -10.38 kcal/mol with high affinity for the active site of PI3K enzyme. Discussion and conclusion In a recent study to identify and introduce new protein targets of boswellic acid, the estrogen receptor protein and the enzyme PI3K, which had the best binding to boswellic acid and its derivatives, were identified and introduced. Evaluation of the interactions of these proteins with boswellic acid and its derivatives showed that the amino acids Met804, Ile963, Asp964, Asp950, Met953, Ser806 and Asn951 may play an important role in binding these compounds to the active site of PI3K enzyme. It also seems that the amino acids Met343, Met421, Phe404, Met388, Leu387, Leu391, Arg394, Leu384, Glu353, Leu346, Leu349, Leu525 and His524 may play an important role in binding these compounds to the active site of the estrogen receptor protein.

نوع سند :پایان نامه (دکتری حرفه ای )
زبان سند : فارسی
استاد راهنما :ساقی سپهری
دانشجو :ندا علیزاده هشی
کلیدواژه ها (فارسی):بوسولیک اسید، داکینگ معکوس، عدد Z
کلیدواژه ها (انگلیسی):Boswellic acid, Inverse Docking, Z-Score
موضوعات :QV فارماکولوژی
بخش های دانشگاهی :دانشکده داروسازی > بخش شیمی دارویی
دانشکده داروسازی > واحد پژوهش - پایان نامه های دفاع شده
کد شناسایی :14583
ارائه شده توسط : آقای فرهاد خدایی
ارائه شده در تاریخ :23 مرداد 1400 07:44
آخرین تغییر :23 مرداد 1400 07:44

فقط پرسنل کتابخانه صفحه کنترل اسناد

Document Downloads

More statistics for this item...