شناسایی مولکولی و تشخیص فاکتورهای ویرولانس گونه هلیکوباکتر پیلوری جدا شده از نمونه های بیوپسی معده

خلاصه فارسی

زمینه : هلیکوباکتر پیلوری مخاط معده انسان را کلونیزه و به عنوان باکتری سرطان زای سطح یک طبقه بندی شده است . مطالعات گذشته نشان داده اشت که برخی از فاکتورهای ویرولانس این باکتری ارتباط مستقیمی با ایجاد بیماری دارد. هدف : این مطالعه با هدف جداسازی هلیکوباکتر پیلوری از نمونه های بیوپسی معده بیماران دارای علائم بالینی مراجعه کننده به کلینیک ارس اردبیل و شناسایی فاکتورهای بیماری زای اصلی آن انجام شد. مواد و روش‌ها : در مطالعه حاضر 287 بیمار با علائم گوارشی وارد مطالعه شدند. پس از اخذ رضایت کتبی، هر بیمار تحت آندوسکوپی قرار گرفت و دو نمونه بیوپسی آنترال گرفته شد. آزمایش اوره آز، کاتالاز و اکسیداز و تکثیر srRNA16(با تعیین توالی Submission # 2419628 16S ribosomal RNA) اساساً برای تشخیص سویه‌های هلیکوباکتر پیلوری مورد استفاده قرار گرفت. از تکنیک uniplex PCR جهت شناسایی فاکتورهای ویرولانس استفاده گردید. یافته‌ها : 70 نفر (24/39%) مبتلا به هلیکوباکتر پیلوری بودند. پس از آندوسکوپی از این تعداد 9 نفر (12.857%) و 2 بیمار (2.875%) به ترتیب دارای زخم معده و سرطان معده بودند. درسویه ها فراوانی ژن های oipA، dupA، iceA1، iceA2، sabA، ureC، vacAs1، vacAs2، hopQ1، cagA، vacAm1، vacAm2، tnpA، hom، hopQ2،tnpB به ترتیب67/14%, 15/71%, 22/85%, 14/28%, 14/28%, 64/28%, 52/85%, 75/71%, 14/28%, 24/28%, 30%, 72/85%, 10%, 10%, 14/28% و 27/14%بود. در این مطالعه 57 الگوی مختلف مربوط به فاکتورهای ویرولانس شناسایی گردید که شایعترینژنوتیپ (28% 3. 4, n=) oipA-vacAs1-vacAm2 و (28% 3. 4, n=)oipA-vacAs1-vacAs2-vacAm2 بود. در هر دو بیماری که سرطان معده داشتند حظور همزمان ژنهای vacAS2, vacAm2 ,hopQ2مشاهده گردید. در افراد مبتلا به زخم معده فراوانی فاکتورهای ویرولانس oipA (n=5,62.5%),vacAs1(n=6,75%), vacAs2(n=6,75%), vacAm1(n=3,37.5%), vacAm2(n=7,87.5%), cagA(n=4,50%), hopQ2(n=4,50%), hopQ1(n=2,25%), iceA1(n=3,37.5%), iceA2(n=2,25%), tnpB(n=5,62.5%), hom(n=2,25%), dupA(n=1 ,12.5%) بود. نتیجه گیری : این تحقیق به بررسی شیوع فاکتورهای مختلف ابتلا به هلیکوباکتر پیلوری در افراد هلیکوباکتر پیلوری مثبت پرداخته است. نتایج این مطالعه نشان داد که ژنهای vacAs1, vacAs2,vacAm2,oipA فراوانی بسیار بالایی در ایزوله های جدا شده از بیماران مبتلا به زخم معده دارد.

عنوان انگليسی

Molecular detection and identification of virulence factors of Helicobacter pylori strains isolated from gastric biopsy specimens

خلاصه انگلیسی

Background: Helicobacter pylori colonizes the human gastric mucosa and is classified as a level 1 carcinogen. In this regards, this study aimed to isolation and detection major virulence factors in related strains which is isolated from gastric biopsy in patients reefed to Aras Clinique in Ardabil, northwest of Iran (2019-2021). Materials and Methods: In this cross-sectional descriptive study, 287 patients with gastrointestinal symptoms were enrolled during the years 2021-2019. After obtaining written consent, each patient underwent endoscopy and two antral biopsy specimens were taken. Urease, catalase and oxidase assays and 16srRNA amplification (accession number: 2419628) were mainly used to detect H. pylori strains. Uniplex PCR technique was used to identify virulence factors. Results: 70 patients (24.39%) had H. pylori,of them , 9 patients (12.857%) and 2 patients (2.875%) had peptic ulcer and gastric cancer, respectively. Frequencies of oipA, dupA, iceA1, iceA2, sabA, ureC, vacAs1, vacAs2, hopQ1, cagA, vacAm1, vacAm2, tnpA, hom, hopQ2, tnpB genes were 67.14%, 15.71%, 22.85%, 14.28%, 14.28%, 64.28%,52.85%,75.71%,14.28%,24.28%,30%,72.85%,10%,10%,14.28% and 27.14% respectively. In this study, 57 different patterns of virulence factors were identified, the most common of which were (3. 4, n =28%) oipA-vacAs1-vacAm2 and (3. 4, n =28%) oipA-vacAs1-vacAs2-vacAm2. Simultaneous presence of vacAS2, vacAm2 and hopQ2 genes was observed in both patients with gastric cancer. Frequency of virulence factors in people with peptic ulcer were oipA (n = 5.62.5%), vacAs1 (n = 6.75%), vacAs2 (n = 6.75%), vacAm1 (n = 3.37.5%), vacAm2 (n = 7.87.5%), cagA (n = 4.50%), hopQ2 (n = 4.50%), hopQ1 (n = 2.25%), iceA1 (n = 3.37.5%), iceA2 (n = 2.25%), tnpB (n = 5.62.5%), hom (n = 2.25%), dupA (n = 1, 12.5%). Conclusion: This study investigated the prevalence of different virulence factors of H. pylori infected individuals. The results of this study showed that vacAs1, vacAs2, vacAm2, oipA genes are very prevalent in isolates taken from patients with peptic ulcer.

Document Downloads