title

بررسی الگوی مقاومت آنتی بيوتيكی و تعیین نقش موتاسیون در ناحیه(QRDR) برمیزان مقاومت به فلوروکینولونها در شيگلاهای جدا شده از بيماران مراجعه كننده به بيمارستان بوعلی اردبيل در سالهای 1393تا1395

پیری دوگاهه, هادی and ارزنلو, محسن and باباپور ایوریق, بهنام (1396) بررسی الگوی مقاومت آنتی بيوتيكی و تعیین نقش موتاسیون در ناحیه(QRDR) برمیزان مقاومت به فلوروکینولونها در شيگلاهای جدا شده از بيماران مراجعه كننده به بيمارستان بوعلی اردبيل در سالهای 1393تا1395. Masters (پایان نامه) دانشگاه علوم پزشکی اردبیل.




[img]
Preview
Text - final reserch project report
480kB
[img]
Preview
Text - final reserch project report
126kB
[img] Text - final reserch project report
محدود به Repository staff only

1MB

Official URL: http://lib.arums.ac.ir

Persian Abstract

سابقه وهدف : فلوروکینولونها در سالهای اخیر در درمان شیگلوزیس بصورت موفقیت آمیزی مورداستفاده قرار گرفته اند.اما جهش در ژنهای gyrAو parC در جایگاه ژنی QRDRاز مکانیسمهای اصلی ایجاد مقاومت در سویه های مقاوم به کینولونها وفلوروکینولونها میباشد.این مطالعه در راستای ارزیابی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی وبررسی جهش های ایجاد شده در سویه های مقاوم به فلورو کینولنها انجام گردید. موادوروشها: این مطالعه بصورت مقطعی بروی 113 نمونه شیگلای جدا شده از 1280 بیمار مراجعه کننده به آزمایشگاه بیمارستان بوعلی اردبیل انجام گردید.شناسایی باکتریها با استفاده از آزمونهای میکروبشناسی ، بیوشیمیایی و سرولوژی وارزیابی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی آنها به روش کربی بایر (Kirby bauer) وتعیین MIC انجام شد. ودر آخر بررسی جهش های ایجاد شده در بین سویه های مقاوم به فلورو کینولونها از طریق تعیین توالی نواحی مربوط به مقاومت در برابر کینولونها( QRDR) در ژنهای gyrA و parC صورت گرفت. یافته ها: بررسی هانشان داد که سروتیپ غالب در منطقه اردبیل شیگلا سونه ای(69/91درصد) میباشد.بررسی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی نشان دادکه بیشترین مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک تری متوپریم+سولفامتوکسازول (82 درصد) و کمترین مقاومت به ایمپنیم با (100 درصد حساسیت) می باشد. و51 درصد سویه ها نسبت به نالیدیکسیک اسید و4/4 درصد به فلوروکینولونها مقاوم بودند .حضور ژنipaH در تمام سویه ها و ژنهای rfc و wbgz به ترتیب در سویه های شیگلا فلکسنری و سونه ای به وسیلهPCR تائید شد. از مجموع 113 سویه جداشده 5 مورد مقاوم به فلوروکینولونها شناسایی شدکه پس از تعیین توالی شاهد جهش هایی در هردو ژن gyrA و parC بودیم .که اصلی ترین جهش ها بصورت جایگزینی ser83 با leu وAsp87 با Asn یاGly در ژن gyrA وجایگزینیser80 با Ile در ژن parC میباشد. نتیجه: نتايج به دست آمده ازبررسی توالی ژن هایgyrA وparC نشان دهنده بروز جهش هایی بود كه باعث ایجاد مقاومت به فلوروکینولونها می گردد ولی در سویه های حساس هیچگونه جهشی مشاهده نگردید. نتیجه گیری: براساس داده های به دست آمده در این تحقیق مقاومت به فلوروکینولونها در شیگلا، در مقایسه با سایر تحقیقات مشابهی که در جاهای مختلف انجام گرفته در منطقه اردبیل هنوز افزایش چشمگیری نداشته است.ودر سویه های مقاوم به کینولونها مقاومت به این آنتی بیوتیکها ارتباط تنگاتنگی با موتاسیون در ژنهای ناحیهQRDR که حاوی ژن هایgyrA و parC می باشد دارند.

Title

The pattern of antibiotic resistance and determining of global QRDR area mutations on Fluoroquinolones resistance in Shigella species isolated from patients referred to Bou-Ali hospital of Ardabil 1393-1395

English Abstract

Background and Objective: Fluoroquinolones have been used successfully in recent years for the treatment of shigellosis, but mutations in the gyrA and parC genes in the QRDR gene location is the main mechanisms for producing resistance to Fluoroquinolones in the strains.This study was conducted to evaluate the antibiotic resistance pattern and consider the mutations in strains with resistance to Fluoroquinolones. Methods: This study was performed on 113 clinical isolated Shigella from 1280 patients referred to the laboratory of Bu-Ali hospital in Ardabil. Fecal samples were cultured in XLD and Hekton Enteric agar for the isolation of Shigella spp, which were identified biochemi¬cally by the standard methods, and grouped serologically by slide agglutination with specific antiseras. Evaluation of antibiotic resistance patterns per-formed by Kirby-bauer method and MIC determination.The last step was evaluating the muta-tions in strains with resistance to Fluoroquinolones by determining the sequence of resistance regions against Fluoroquinolones in the gyrA and parC genes. Result: The study showed that Shigella sonnei is the dominant serotype in the Ardabil area (69.9%). Antibiotic resistance pattern showed that it was the most resistant to Trimethoprim- Sulfamethoxazol (82%) and the least resistance to Imipeneme (100%sensitive). 51% of strains were resistant to Nalidixic acid and 4.4% of strains were resistant to Fluoroquinolones. The presence of ipaH gene in all strains, and rfc and wbgz in Shigella flexneri and Shigella sonnei strains, confirmed by PCR. Of the 113 isolates, 5 cases were detected resistant to Fluoroquinolones. After determining the sequence, mutations were detected in both gyrA and parC genes. The main mutations were replaced Ser80 with Leu and Asp87 with Asn or Gly in gyrA gene and Ser80 replacement with Ile in parC gene. Conclusion: The result of the study of gyrA and parC genes sequence shows the mutations that cause resistance to Fluoroquinolones, but none of this mutations were observed in suscep-tible strains

Item Type:Thesis (Masters)
زبان سند : فارسی
استاد راهنما :هادی پیری دوگاهه
استاد مشاور :محسن ارزنلو
دانشجو :بهنام باباپور ایوریق
Additional Information:شماره پایان نامه : 032 ، پایان نامه کارشناسی ارشد میکروب شناسی پزشکی
Uncontrolled Keywords:شیگلا، مقاومت آنتی بیوتیکی، مقاومت نسبت به فلوروکینولونها، ژن gyrA ، ژنparC ، موتاسیون
کلیدواژه ها (انگلیسی):Shigella, Antibiotic resistance, Fluoro-quinolone resistance, mutation, gyrA gene, parC gene
Subjects:QW Microbiology and Immunology
WI Digestive System
Divisions:Faculty of Medicine > research unit > sumitted thesis
Faculty of Medicine > Department of Basic Sciences > Department of Parasitology
Faculty of Medicine > Department of Basic Sciences > Department of Microbiology
ID Code:9147
Deposited By: farhad khodaei
Deposited On:30 Jun 1396 08:07
Last Modified:30 Jun 1396 08:07

Repository Staff Only: item control page

Document Downloads

More statistics for this item...