رزاقی اصل, نیما ، هاشمی, نیلوفر (1400) طراحی ترکیبات بالقوه آنتی لیشمانیا به روش شبیه سازی مولکولی. Journal of Molecular Modelling Graphics and Modelling ــ 110 (108039). ص.ص.108039-110. شاپا 1093-3263
متن کامل
![]() |
متنی
- نسخه چاپ شده
محدود به فقط پرسنل سامانه 922kB |
آدرس اینترنتی رسمی : https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/...
عنوان انگليسی
Identification of potential antileishmanial agents via structure-based molecular simulations
خلاصه انگلیسی
Leishmaniasis is a parasitic disease with frequent annual incidence. An important issue in chemotherapy is the emergence of resistance, toxicity and lack of cost-effectiveness within current drugs. Therefore, it is of utmost importance to design effective drugs against disease. Current contribution was devoted to the in-silico analysis of binding a few flavonoids/alkaloids to relevant leishmanial targets. Docking scores were used to prioritize ac- quired affinities and top ranked binders were subjected to subsequent 100-ns MD simulation in explicit water. Binding trajectories revealed the tightest interaction modes for two flavonoid molecules (acerosin and neva- densin) in the uracil DNA glycolase (UDG) active site. Acerosin showed less conformational changes whereas, nevadensin interacted stably during longer simulation time. Conserved interactions of Gln205 and His331 to acerosin indicated their dominant biological role in complex stability. No conserved residues were perceived for nevadensin interactions and a completely new and stable binding conformation could be retrieved after 12 ns simulation. Moreover; acerosin was subjected to DFT analysis for pairwise decomposition evaluations of inter- acted residues. Although primary mechanisms of action are yet to be discovered, UDG may be a promising target for developing antileishmanial flavonoids.
نوع سند : | مقاله |
---|---|
زبان سند : | انگلیسی |
نویسنده مسئول : | نیما رزاقی اصل |
نویسنده : | نیلوفر هاشمی |
ضریب تاثیر و نمایه مجلات: | IF: 2.518 Indexed in: ISI , PubMed/Medlin , Scopus |
کلیدواژه ها (فارسی): | لیشمانیا , تارگت , داکینگ , دینامیک مولکولی , فلاونوئید , مسیر واکنش |
کلیدواژه ها (انگلیسی): | Leishmania , Target , Docking , Molecular Dynamics , Flavonoid , Binding trajectory |
موضوعات : | QV فارماکولوژی > QV 744 شیمی دارویی |
بخش های دانشگاهی : | دانشکده داروسازی > بخش شیمی دارویی |
کد شناسایی : | 14841 |
ارائه شده توسط : | دکتر نیما رزاقی اصل |
ارائه شده در تاریخ : | 16 آذر 1400 13:36 |
آخرین تغییر : | 16 آذر 1400 13:36 |
فقط پرسنل کتابخانه صفحه کنترل اسناد